Кафедра информационных систем и технологий по сравнению со многими другими кафедрами университета существует сравнительно недавно – с октября 1983 г. Её возникновение было вызвано созданием во второй половине XX в. первых ЭВМ и, как следствие, появлением огромного числа новых задач и возможностей. Практически во всех инженерных областях для осуществления сложных расчётов стала использоваться вычислительная техника, и возросла потребность в преподавании дисциплин, связанных с применением ЭВМ.

С момента образования кафедра успела сменить несколько названий, а также менялись и расширялись направления её деятельности. В первую очередь это было связано с появлением новых технологий и новых потребностей отрасли.

Изначально кафедра получила название кафедры прикладной математики и начала свою деятельность под руководством проректора по научной работе ЛИСИ, доктора технических наук, профессора Виталия Захаровича Васильева.

Коллектив преподавателей сформировался из перешедших с кафедры высшей математики Владимира Васильевича Карпова, Леонида Даниловича Пекарева и Людмилы Александровны Шушариной. Кроме того, на кафедру были приняты новые для университета сотрудники –  Евгений Борисович Любимов, Сергей Николаевич Никифоров, Татьяна Петровна Ильина.

Основными дисциплинами, читаемыми на кафедре, стали «Программирование для ЭВМ» и «Численные методы». На кафедру было возложено руководство советом по вычислительной технике и научное руководство вычислительным центром ЛИСИ. Стал выходить сборник научных трудов «Аналитические и численные решения прикладных задач математической физики». Проведение мероприятий по всеобщей подготовке преподавателей вуза по программированию и вычислительной технике также стало обязанностью кафедры.

С момента основания кафедры начинают формироваться направления её научной деятельности – математическое моделирование в задачах нелинейного расчёта тонкостенных конструкций (Владимир Васильевич Карпов), разработка теории параллельного диагностирования дискретных объектов (Сергей Николаевич Никифоров).

В 1985 г. заведующим кафедрой стал доктор технических наук профессор Николай Викторович Варламов. На кафедру пришли преподаватели Владимир Валентинович Шацков и Марина Викторовна Шацкова.

В 1986 г. кафедра была преобразована в кафедру автоматизированных систем проектирования и управления, а в сентябре 1987 г. из неё выделилась кафедра вычислительной математики.

Заведующим кафедрой стал профессор Борис Георгиевич Вагер. Под его руководством на кафедре появилось новое научное направление, связанное с изучением пограничных слоёв атмосферы и океана, а также математическим моделированием турбулентного течения жидкости применительно к задачам метеорологии.

К коллективу преподавателей присоединились Андрей Юрьевич Гарнаев, Виктор Абрамович Фролькис, Ольга Алексеевна Шебшаевич. А. Ю. Гарнаев начал развивать направление, связанное с математической кибернетикой и теорией игр.

Защитили кандидатские диссертации преподаватели В. В. Шацков (под руководством В. В. Карпова), О. А. Шебшаевич, М. В. Шацкова; В. В. Карпов и А. Ю. Гарнаев стали докторами наук.

С 1988 по 2000 г. на кафедру пришли работать Мария Александровна Милютина, Татьяна Германовна Капитонова, Надежда Николаевна Петухова, Людмила Константиновна Нарбут, Мария Фёдоровна Яковлева, Анатолий Михайлович Кокорин, Лидия Фёдоровна Васенина, Ольга Викторовна Букунова.

В этот период в университете открылись дисплейные классы, что позволило проводить занятия с использованием персональных компьютеров. К 2002 г. две учебные лаборатории (заведующие – Мария Александровна Милютина и Леонид Григорьевич Литвиненко) обеспечивали проведение учебного процесса в четырёх дисплейных классах.

Начал выходить сборник научных трудов «Численные методы в математическом моделировании гидродинамических и технологических процессов» (с 1993 г. он стал называться «Математическое моделирование, численные методы и комплексы программ»).

В 1993 г. при кафедре открылась аспирантура по специальностям «Применение вычислительной техники и методов вычислительной математики в научных исследованиях» и «Теоретические основы математического моделирования, численные методы и комплексы программ». С 1994 г. начал функционировать диссертационный совет, работавший (с перерывом) до 2007 г.

В 1999 г. на основании постановления Учёного совета университета кафедра вычислительной математики была переименована в кафедру прикладной математики и информатики.

Благодаря усилиям Бориса Георгиевича Вагера в 2000 г. кафедра стала выпускающей по специальности «Прикладная математика», и в 2005 г. был осуществлён первый выпуск 14 инженеров-математиков.

В связи с появлением большого количества новых узкопрофильных дисциплин на кафедру были приглашены профессора Е. Л. Генихович, Ю. К. Демьянович, Ю. И. Ингстер, Б. П. Харламов, В. И. Воробьёв.

В 2010 г. заведующим кафедрой ПМИ стал профессор Сергей Николаевич Никифоров. В последующие годы в коллектив пришли И. А. Евсиков, Л. П. Москаленко, М. М. Ромаданова, А. А. Семенов, С. В. Букунов.

В связи с переходом на бакалавриат и магистратуру в 2015–2019 гг. кафедра выпускала бакалавров по направлению «Прикладная математика». С 2013 г. по инициативе С. Н. Никифорова в связи с активным развитием информационных технологий было открыто новое направление подготовки – «Прикладная математика и информатика» (сначала бакалавриат, а затем и магистратура).

Начиная с 2017 г. кафедра вновь изменила своё название, став кафедрой информационных технологий. Руководство кафедрой осуществлял Алексей Александрович Семенов.

Примерно в это же время одним из основных направлений деятельности кафедры стало развитие и внедрение в образовательный процесс BIM-технологий как основы для цифровизации в строительной отрасли. В связи с большой потребностью в специалистах, владеющих и технологиями BIM и технологиями программирования, с 2020 г. открыты новые направления подготовки «Информационные системы и технологии» (бакалавриат и магистратура).

В этот период одним из основных направлений деятельности кафедры стало развитие и внедрение в образовательный процесс BIM-технологий как основы для цифровизации строительной отрасли. В связи с большой потребностью в специалистах, владеющих и технологиями BIM, и технологиями программирования, с 2020 г. открыты новые направления подготовки «Информационные системы и технологии» (бакалавриат и магистратура). В 2023 г. кафедра начала подготовку выпускников по направлению подготовки «Прикладная информатика» (бакалавриат и магистратура).

В 2023 г. кафедра вновь была переименована, получив название кафедры информационных систем и технологий.