Кафедра была создана в 1999 г. на базе кафедры экономики строительства и кафедры автоматизированных систем проектирования и управления. Первое название кафедры – кафедра управления.
Одним из основателей кафедры был Н. В. Варламов, лауреат Государственной премии СССР, заслуженный деятель науки и техники Российской Федерации, доктор технических наук, академик Российской и Санкт-Петербургской инженерных академий, член-корреспондент Петровской академии наук и искусств, советник Российской академии архитектуры и строительных наук, почётный профессор Оксфордской образовательной сети. В настоящее время профессор Варламов является консультантом-наставником.
Более 10 лет передавал свои знания студентам направления подготовки «Менеджмент» профессор, доктор экономических наук, заслуженный строитель Российской Федерации, почётный строитель России, почётный гражданин России, лучший менеджер России, «Человек года» в номинации «Экономическое возрождение России» (2001 г.), почётный архитектор России, лауреат Национальной общественной премии им. Петра Великого, председатель совета директоров группы компаний «Эталон» В. А. Заренков.
В 2015 г. кафедра была переименована в кафедру управления организацией путем слияния кафедры управления и кафедры практической психологии.
В 2018 г. кафедра была переименована в кафедру менеджмента в строительстве, чему предшествовало расформирование кафедры экономики предпринимательства и инноваций.
В 2013 году состоялся первый набор на образовательную программу «Логистика и управление цепями поставок».
С 2004 по 2020 гг. кафедру возглавлял д. э. н., проф. А. А. Петров.
Все преподаватели кафедры обладают высокой квалификацией. В их числе – пять докторов и семь кандидатов наук.